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人文社会科学

中亚文明与西向开放协同创新(培育)中心     新疆少数民族教育发展与教育政策研究中心

兵团屯垦戍边研究中心       公司治理与管理创新研究中心   兵团屯垦经济研究中心

新疆非物质文化遗产研究中心   新疆社会治理现代化研究中心   中国特色社会主义理论体系研究中心

兵团金融发展研究中心      棉花经济研究中心        农业现代化研究中心

石河子大学心理应用研究中心


工程科学

新疆特色果蔬贮藏加工教育部工程研究中心      绿洲农业工程与信息化教育部工程研究中心

特色作物生产机械装备国家地方联合工程实验室    特色果蔬国家地方联合工程研究中心

空间信息获取与应用技术国家地方联合工程实验室   新疆兵团化工绿色过程国家重点实验室

兵团农业机械重点实验室               现代节水灌溉兵团重点实验室

氯碱化工清洁生产与产品高值化技术协同创新(培育)中心   兵团空间信息工程技术研究中心

新疆兵团特色果蔬加工工程技术研究中心       材料化工工程技术中心

材料化工重点实验室                农产品加工工程重点实验室

农业部西北农业装备重点实验室


医学科学

新疆地方与民族高发病教育部省部共建重点实验室    新疆特种植物药资源教育部省部共建重点实验室

新疆地方性高发病国家国际科技合作基地        西部地区高发人兽共患传染性疾病防治协同创新中心


农学科学

新疆兵团绿洲生态农业国家重点实验室          特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室

新疆绿洲农业病虫害治理与植保资源利用重点实验室   棉花生产技术现代化协同创新中心

动物疾病防控兵团重点实验室              动物遗传改良与疾病控制重点实验室

动物健康养殖国际联合研究中心